(一)位于南京。东晋永和四年（348），谢尚捐舍自宅改建为寺，称庄严寺，或称塔寺。刘宋时，文帝曾临本寺设斋，后改为“谢镇西寺”，又号“谢寺”。先后有慧次、僧宝、僧智、智宗等入住。陈太建元年（569）焚毁，五年重建，改称“兴严寺”。至明永乐二十一年（1423），真常重兴，恢复旧名。

(二)南京宣阳门外，亦有同名之寺，系刘宋大明三年（459）路太后所建，有七重塔等。为区别梁代所建之小庄严寺，而称本寺为大庄严寺。先后有僧密、昙斌、昙济、昙宗、慧亮、僧谦、僧旻等高僧居之，盛极一时。刘宋明帝、南齐高帝、昭明太子等，均曾至此听讲、咨论佛法。陈代时，武帝屡舍身入寺，宣讲金光明经之大纲，并设无遮大会。隋以后渐衰，唐时牛头山慧忠于此建法堂，重修堂舍，其后沿革不详。

(三)位于南京之定阴里。世称小庄严寺。原为晋零陵王之庙地，梁天监六年（507）邹（邵）文立创建。文立尝杀怀孕母鹿，故患眼疾，心深忏悔，求道于度禅师，为度禅师舍家资而建本寺。［梁高僧传卷七、卷八、卷十一、南史本纪第五东昏侯］ p4777